Dr. Baka Erzsébet - Akvakultúra és Környezetbiztonsági Intézet
Molekuláris Ökológia Tanszék
Bemutatkozás?
Fő kutatási területe a környezeti mikrobiológia és a mikrobiális közösségek bioinformatikai elemzése. Kutatásai során környezeti mintákból (talaj, talajvíz) izolált mikroorganizmusok, valamint komplex mikrobiális közösségek vizsgálatával foglalkozik. Munkájában klasszikus mikrobiológiai és modern molekuláris módszereket ötvöz nagy áteresztőképességű szekvenálási adatok bioinformatikai feldolgozásával, beleértve 16S rDNS amplikon szekvenálást, metagenomikai elemzéseket, valamint teljes genomok mély, funkcionális és komparatív genomikai analízisét. Kutatásai kiterjednek mikrobiális degradációs folyamatok genetikai hátterének feltárására, új baktériumfajok genomikai jellemzésére, valamint mikotoxin-bontásban részt vevő mikrobák és az ehhez kapcsolódó enzimatikus útvonalak transzkriptomikai vizsgálatára. Emellett genetikai eszközrendszerek fejlesztésével, valamint mesterséges génkonstrukciók tervezésével és összeállításával is foglalkozik. Aktív résztvevője hazai és nemzetközi kutatási projekteknek, valamint egyetemi oktatásban és hallgatók témavezetésében is közreműködik.
Publikációk
Kiemelt publikációk:
Kosztik, J., Baka, E., Táncsics, A., Ábrahám, R., Szabó, G., Nagy, I., ... & Nagy, I. (2026). Genomic and proteomic analyses of the maize root isolate Rhodococcus erythropolis NI86/21 reveal extensive genome plasticity and parallel evolution of herbicide degradation. Applied and Environmental Microbiology, e02407-25.
Sinchan, B., Táncsics, A., Wu, Z., Stafioiu, T., Gao, J., Tóth, E., Baka, E., Bending, G., Schäfer, H. (2025) Foliimonas ilicis gen. nov., sp. nov., a carbon monoxide-oxidizing bacterium belonging to a novel genus of the family Phyllobacteriaceae isolated from leaves of Ilex aquifolium. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 75:11 Paper: 006953
Ábrahám, R., Baka, E., Al-Nussairawi, M., Táncsics, A., Farkas, M., Nagy, I., ... & Cserháti, M. (2025). Molecular insights into ochratoxin A biodegradation. Biologia Futura, 76(3), 315-328.
Táncsics A., Bedics A., Banerjee S., Soares A., Baka E., Probst AJ., Kriszt B. (2024) Stable-isotope probing combined with amplicon sequencing and metagenomics identifies key bacterial benzene degraders under microaerobic conditions. Biologia Futura, 75(3), 301-311
Molnár H., Bata-Vidács I., Baka E., Cserhalmi Z., Ferenczi S., Tömösközi-Farkas R., Adányi N., Székács A. (2018) The effect of different decontamination methods on the microbial load, bioactive components, aroma and colour of spice paprika. Food Control, 83 (131-140)
Projektek
Frequently asked question?